種子休眠的原因各不相同 ， 但大致可分為三種類型 。
一、胚的后熟作物種子成熟過(guò)程中 ， 胚及其周圍的組織成熟的程度不一 。即使種子已經(jīng)脫落 ， 有的胚還沒(méi)有成熟 。這類種子只能在胚發(fā)育完成之后才發(fā)芽 。另外 ， 也有的胚即使在形態(tài)上完善了 ， 而在生理上卻未成熟 。只有當(dāng)胚完成了后熟之后 ， 種子才能從休眠狀態(tài)過(guò)渡到萌發(fā)狀態(tài) 。
二、硬實(shí)（種子透性不良）種子在成熟時(shí)變成了硬實(shí) ， 種皮不透水、不透氣 ， 因而不發(fā)芽 。豆類特別是小粒豆類作物的種子比經(jīng)較容易形成硬實(shí) ， 如綠豆、紫云英等 。大粒豆類作物如大豆 ， 在干燥、高溫、氮素多的環(huán)境下種植 ， 也常常產(chǎn)生硬實(shí) 。變成硬實(shí)的種子 ， 其臍部產(chǎn)生硬實(shí)結(jié)構(gòu) ， 阻礙著水分的吸收 ， 因而不能發(fā)芽 。
三、發(fā)芽的抑制物質(zhì)種子休眠的重要原因之一是果實(shí)和種子中含有某種抑制發(fā)芽的物質(zhì) ， 致使種子發(fā)不了芽 。水稻種子的抑制物質(zhì)存在于谷殼之中 ， 小麥在種皮里 。據(jù)分析 ， 抑制小麥發(fā)芽的主要成分之一 ， 是三羥基黃烷酮和五羥基黃烷 。
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