公積金扣款會二次補扣的，當公積金賬戶第一次扣款額度不足的話，在還款日當天，系統(tǒng)會進行二次補扣，所以賬戶額度不足的情況下，貸款人要注意往賬戶內匯款，補足資金 。有些銀行在還款日第二天還會繼續(xù)進行補扣，具體以銀行規(guī)定為準 。
公積金還款逾期怎么辦1、如果是自由還款方式下產生逾期，可通過兩種方式進行操作：
(1)借款人在合同約定的還款日償還逾期個人貸款，可先通過呼叫核心電話委托系統(tǒng)查詢到下一還款日至少應償還的貸款金額(該金額應為逾期貸款本息、罰息及較低還款額之和)，即借款人若按此金額在下一還款日還款，則貸款不再逾期 。
借款人再通過呼叫核心電話委托系統(tǒng)調整還款額度或到貸款業(yè)務部門簽定《借款人調整月還款額通知書》，確定下一還款日的還款額 。
(2)借款人在非合同約定的還款日償還逾期個人貸款，須持本人身份證原件到貸款業(yè)務部門柜臺辦理相關手續(xù) 。借款人先向貸款業(yè)務部門提出申請，設定一個約定還款日，約定還款日的范圍為：
借款人到管理部辦理還款手續(xù)的三天(不含)后至下一個合同約定還款日(不含)之前 。但借款人每期只能到柜臺辦理一次非合同約定還款日逾期個人貸款償還手續(xù) 。借款人填寫《償還逾期個人住房擔保委托貸款承諾書》(一式兩份，個人和貸款業(yè)務部門各持一份) 。
罰息金額=用逾期的本息×罰息的利率(貸款的年利率÷360天×150%)×逾期的天數(shù) 。
2、如果是等額本金或等額本息還款方式下產生逾期，借款人償還逾期貸款仍通過其還款賬戶由銀行進行扣劃，無須對償還逾期貸款進行預約：
(1)非合同約定還款日償還：中心于每周三的前一個工作日將逾期貸款數(shù)據(jù)傳輸給銀行，要求銀行于周三對逾期貸款借款人存入還款賬戶的資金進行扣劃 。
【公積金扣款會二次補扣嗎】(2)借款人在合同約定還款日償還逾期，中心將借款人逾期總額以及當月應還款額在合同約定還款日的前一個工作日，向銀行一并通知并由銀行進行扣劃 。
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