在我國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)進入快速發(fā)展、集約化養(yǎng)殖不斷擴大、產(chǎn)量大幅度提高的同時也帶來負面影響——養(yǎng)殖水體嚴重污染 。養(yǎng)殖水體污染是由人類的養(yǎng)殖活動，養(yǎng)殖對象自身分泌、排泄，餌料過剩等因素造成，水質因子平衡失調，促使病原菌大量滋生，引起多種水產(chǎn)疾病頻發(fā)：
1.水體富營養(yǎng)化引起有利藻類生長被毒害藻類生長所替代，改變了藻類種群，水體毒性增強，水體溶氧劇烈波動及魚類疾病的并發(fā) 。
2.重金屬的富集、吸附作用影響水生生物的生長，如水體受重金屬（汞、鉛、鎘等）及其他有毒物質（如氯化物、砷化物、亞硝酸鹽等）污染，易引起各種中毒和疾病 。
3.環(huán)境遭到破壞，水化因子改變，水體惡化，影響魚類生長和魚產(chǎn)品質量等 。
養(yǎng)殖水體污染類型及來源
養(yǎng)殖水體自身污染：營養(yǎng)調控不當造成水體污染，由于投喂飼料的單一性，飼料中營養(yǎng)元素成分不齊全，餌料系數(shù)偏高，攝食量下降導致殘餌過多，影響魚類生長，易造成傳染性疾病和營養(yǎng)性疾病 。隨著養(yǎng)殖密度的增加、投餌量增大、水體負載超過飽和程度；養(yǎng)殖生產(chǎn)中餌料過剩，產(chǎn)生大量氮、磷等營養(yǎng)元素，水體富營養(yǎng)化，有害藻類暴發(fā)性生長；水體溶氧日差大，易缺氧；此外，營養(yǎng)物質的不平衡，養(yǎng)殖種類氨、氮排泄物過多，磷的有效吸收較低等都是營養(yǎng)不當帶來的污染 。
藥物的濫用：養(yǎng)殖規(guī)模和面積不斷擴大，病害流行日趨嚴重 。目前，水產(chǎn)疾病防治技術的滯后及養(yǎng)殖戶用藥知識匱乏，導致大部分養(yǎng)殖戶不能對癥下藥，不能仔細分析病因，濫用價格低廉、殘留嚴重的各種抗生素、化工原料等 。這樣不但對治療魚病無效，反而帶來嚴重的污染及毒害作用，使細菌、病毒等產(chǎn)生耐藥性而大量繁殖，疫病蔓延，影響水產(chǎn)品品質 。有些藥物雖然對治愈病害起到一定作用，但造成水體嚴重污染，且很大程度上破壞水體環(huán)境及水產(chǎn)養(yǎng)殖品種體內(nèi)微生態(tài)平衡，使養(yǎng)殖對象失去一些正常生理屏障及生物拮抗作用，病原菌易于繁殖，魚產(chǎn)品質量不能達到健康養(yǎng)殖標準 。
外源性污染：工農(nóng)業(yè)生產(chǎn)污水和居民生活廢水、廢物常常未經(jīng)處理就直接排入江河、湖泊、海洋等，成為污染漁業(yè)水域生態(tài)環(huán)境的主要原因之一 。生活污水中鐵、錳、氫氧化物懸浮物所引起的渾濁，雖不產(chǎn)生直接危害，卻能降低水體透明度，減少太陽輻射，限制了魚類正常活動和攝食；生活污水中有機物大量富集出現(xiàn)，水體富營養(yǎng)化而導致魚類缺氧浮頭 。
工業(yè)廢水對漁類污染具有毀滅性危害，造紙廠的硫化物可致死魚類；農(nóng)藥廠的產(chǎn)品和原料毒害作用比較大；熱電廠的廢水是熱污染主要來源，引起水溫聚升，使魚種群改變或死亡；電鍍等行業(yè)中產(chǎn)生含氰化物廢水，合成洗滌劑的廢水等都具有嚴重的危害性 。
有毒物質的污染：水體中各種有毒物質，如飼料污染中的硫化氫、氨氮等有害物質，工業(yè)污染中的氰化物、鉻、銅、洗滌劑等有毒物質進入水體后都會不同程度影響水生生物 。濃度過高，會迅速直接殺死水生生物，濃度低，先富集于生物體內(nèi)，進而轉化產(chǎn)生危害 。
病原微生物污染：由于養(yǎng)殖過程中的不合理養(yǎng)殖管理模式，如長期不清淤、大量投喂鮮餌、放養(yǎng)密度過大、養(yǎng)殖容量超載等，導致底質中有機物含量過高，病原微生物大量繁殖引起污染 。如，在寄生蟲性病害中，以有機質細菌為主食的孢子類、鞭毛類等原生動物大量繁殖；在病毒性病害中，南美白對蝦、日本對蝦等養(yǎng)殖中流行以白斑綜合征為主的對蝦病毒；在細菌性病中，弧菌、假單胞菌等給水產(chǎn)養(yǎng)殖動物帶來直接或間接危害；病原微生物直接致病，與治病過程中帶來的藥物污染一起破壞水體，危害魚類 。
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