1、分子伴侶對靶蛋白沒有高度專一性，同一分子伴侶可以促進多種氨基酸序列完全不同的多肽鏈折疊成為空間結(jié)構(gòu)、性質(zhì)和功能都不相關(guān)的蛋白質(zhì) 。
2、它的催化效率很低 。
3、它和肽鏈折疊的關(guān)系，是阻止錯誤折疊，而不是促進正確折疊 。
酶（enzyme）是由活細胞產(chǎn)生的、對其底物具有高度特異性和高度催化效能的蛋白質(zhì)或RNA 。酶的催化作用有賴于酶分子的一級結(jié)構(gòu)及空間結(jié)構(gòu)的完整 。若酶分子變性或亞基解聚均可導致酶活性喪失 。酶屬生物大分子，分子質(zhì)量至少在1萬以上，大的可達百萬 。
【分子伴侶和酶的區(qū)別】酶是一類極為重要的生物催化劑（biocatalyst） 。由于酶的作用，生物體內(nèi)的化學反應在極為溫和的條件下也能高效和特異地進行 。
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