為了促進(jìn)藏獒的選育、提純和品質(zhì)改良，僅僅重視對(duì)藏獒的選擇是不夠的，還必須注意并加強(qiáng)藏獒的配種 。但不是藏獒在原產(chǎn)地的自然交配，而是人們有目的、有意義地選取在性狀表現(xiàn)、性能特征乃至親緣關(guān)系等方面有一定特色的公母犬進(jìn)行交配 。
等級(jí)選配即按藏獒綜合評(píng)定等級(jí)標(biāo)準(zhǔn)對(duì)與配公母犬進(jìn)行等級(jí)評(píng)定，確定公母犬的等級(jí)后，再確定公母犬的配對(duì)或交配 。通常公犬的評(píng)定等級(jí)應(yīng)高于母犬，每世代主配公犬應(yīng)達(dá)到特級(jí)，不低于一級(jí)，個(gè)別具備獨(dú)特性能或特征母藏獒容許二級(jí) 。公犬的等級(jí)按特級(jí)或一級(jí)要求，原因在于公犬影響面大 。
保持血統(tǒng)保持血統(tǒng)的意義在于保持以血統(tǒng)為特征的不同犬類型 。據(jù)調(diào)查，藏獒有6種基本毛色，并各自在頭形、嘴形、尾形、被毛分布、氣質(zhì)品位等方面具有特色 。按血統(tǒng)選擇公母犬交配，可以有效地把不同血統(tǒng)公母犬所具有的性狀與特征集合在一起，創(chuàng)造出理想的藏獒個(gè)體，也可以把各血統(tǒng)藏獒所具備的優(yōu)良性能和特征穩(wěn)定下來并保持下去 。
品質(zhì)選配這種交配方式是根據(jù)公母犬的品質(zhì)對(duì)比而決定是否交配 。即選取在性狀表現(xiàn)、性能特征、氣質(zhì)表現(xiàn)以及與適應(yīng)性有關(guān)的性狀上相同或不相同的個(gè)體進(jìn)行交配 。根據(jù)與配公母犬在體型、外貌、體質(zhì)、體尺以及毛色等方面的表現(xiàn)，有時(shí)可以進(jìn)行同質(zhì)交配，有時(shí)可以進(jìn)行異質(zhì)交配；有時(shí)可先同質(zhì)、后異質(zhì)；也可某幾個(gè)性狀上是同質(zhì)，另外的性狀上卻可是異質(zhì) 。在決定毛色的染色體的同一位點(diǎn)上至少存在著6對(duì)等位基因，這些等位基因之間存在著顯性、等顯性、無顯性等不同關(guān)系 。
【藏獒的選配方法】例如，黑色公犬交配紅棕色母犬，后代有黑色、紅棕色、巧克力色，呈無顯性遺傳 。如果用紅棕色公犬與黑色母犬交配，即反交，后代中除出現(xiàn)黑色與紅棕色幼犬外，還會(huì)有狼青色個(gè)體出現(xiàn) 。除純黑色、四眼毛色犬外，其他如紅棕色、杏黃色藏獒在幼小階段都表現(xiàn)著色程度不同的青灰色胎毛，3月齡左右，胎毛逐漸退去，開始出現(xiàn)黃色或紅棕色 。判斷足月小犬未來顏色最重要的部位是耳后的毛色 。
根據(jù)耳后的毛色基本可以確定一生的毛色 。在藏獒中所占比率最高的四眼毛色，雖然生來具有，但眉斑有大小，顏色有深淺 。標(biāo)準(zhǔn)的四眼毛色應(yīng)該為眉斑大而圓，斑緣整齊、清晰，顏色以紅色最佳，黃色較好，白色四眼較差 。
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