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魚在水中能夠通過呼吸進(jìn)行新陳代謝，主要是它擁有一個(gè)重要器官——腮。鰓是專門適應(yīng)水中呼吸的構(gòu)造。魚的咽喉兩側(cè)各有4個(gè)鰓，每個(gè)鰓又有鰓片和鰓絲組成。呼吸時(shí)，鰓片和鰓絲完全打開，會(huì)增大鰓與水的接觸面積，增加與水中溶解氧結(jié)合的機(jī)會(huì) 。

魚在水中，嘴巴一張一閉的進(jìn)行呼吸；它張嘴時(shí)，把水吸入，鰓蓋關(guān)閉，閉嘴時(shí)，鰓蓋打開，讓水流出。在水流經(jīng)腮的過程中，水中的溶解氧就被鰓上的微血管吸收，同時(shí)把二氧化碳排入水中，魚只要一旦離開水，它的鰓片、鰓絲粘合重疊在一起，不能及時(shí)得到氧而窒息。

還有一種特殊的魚，肺魚。它是一種和腔棘魚類相近的淡水魚。古代時(shí)曾在地球上大量繁殖，現(xiàn)在仍有少數(shù)保存著其種族而遺留下來，可以說是一種“ 活化石” 。頜為自接式，平時(shí)用鰓呼吸，在干涸時(shí)可以用鰾當(dāng)作肺呼吸，鰾在食道處有一開口，可以叫做內(nèi)鼻孔，背鰭、臀鰭和尾鰭愈合在一起，頜上沒有硬骨，有特殊的齒板。肺魚在軟組織的構(gòu)造、發(fā)育、生理和行為方面有許多性狀與現(xiàn)生兩棲類接近而不同于其他現(xiàn)生魚類，例如美洲肺魚具有以聲門與食道相接的雙肺，鰓及鰓部血管較退化，心臟具二心室，其一接受來自肺部的血液，動(dòng)脈錐有瓣膜將來自肺部的血液與來自鰓部的血液分開。不久前，有些學(xué)者提出，肺魚在具有會(huì)厭軟骨、腦下垂體結(jié)構(gòu)及其激素成分、晶狀體蛋白、膽汁鹽、鰓弓肌肉等方面亦與現(xiàn)生兩棲類最為接近。

魚和人一樣，需要吸入氧氣，呼出二氧化碳，離開了氧氣，生命將進(jìn)入倒計(jì)時(shí) 。
【魚缸里的魚浮到水面大口呼吸有的魚為什么在水面呼吸】

魚之所以能在水中存活，因?yàn)樗腥芙獾挠猩倭康难鯕猓ù笄疤幔?。
人有肺，能過濾空氣中的氧氣卻對(duì)水中的氧氣無從下嘴，因此人只能在陸地生活，而魚有鰓（小前提），可以從水中把少有的氧氣過濾出來，供自身使用。

魚在水中時(shí)，每個(gè)鰓片、鰓絲都完全張開，增大魚鰓和水的接觸面積，從而增加過濾水中所溶解的氧的機(jī)會(huì) 。在鰓小片中有微血管，類似于人的肺泡，其表皮很薄，當(dāng)血液流過這里時(shí)可以完成氣體交換：將攜帶的二氧化碳透過鰓小片的薄壁，送到水中，進(jìn)而排出體外；同時(shí)，攝取水中的氧，氧隨血液循環(huán)輸送到身體各部分，參加生命活動(dòng) 。