清朝在239年間共設置105任巡撫 。順治四年設福建巡撫，首任巡撫是佟國鼐，光緒十一年改設臺灣巡撫，福建巡撫一職由總督兼理 。
1、佟國鼐于1647年到1648年擔任福建巡撫；
2、張學圣于1648年到1653年擔任福建巡撫；
3、佟國器于1653年到1655年擔任福建巡撫；
4、劉漢祚于1656年到1659年擔任福建巡撫；
5、徐永禎于1659年到1661年擔任福建巡撫；
6、許世昌于1661年到1666年擔任福建巡撫；
7、劉秉政于1666年到1674年擔任福建巡撫；
8、楊熙于1674年到1678年擔任福建巡撫；
9、吳興祚于1678年到1681年擔任福建巡撫；
【清代歷任福建巡撫名單】10、董國興于1682年到1683年擔任福建巡撫 。
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