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溫度過高或過低均會導致棉花種子發芽率下降 。
土壤水分含量不足，棉花種子無法吸收足夠的水分 。
土壤透氣性較差，氧氣含量不足，棉花種子進行無氧呼吸并產生有毒物質，導致發芽率下降 。
種子貯存時間過長，活力較差 。
覆土過厚，棉花種子難以出土 。
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【棉花種子在多少溫度下不發芽 棉花種子不發芽的原因】一、溫度過低或過高
1、棉花種子發芽適宜溫度為28-30℃左右，最低臨界溫度為10.5-12℃左右，最高臨界溫度為43-45℃左右 。
2、當環境溫度過低或者過高時，均會導致棉花種子的發芽率有所下降 。據了解，當環境溫度為8℃、12℃、20℃、24-28℃時，棉花種子發芽率分別為為40-50%左右、65-75%左右、80-95%左右、85-100%左右 。
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二、土壤水分不足
1、棉花種子在發芽過程中從土壤中吸收水分，可使種子體積迅速增大 ， 種皮變軟或破裂，同時增強通透性，從而有利于后續胚突變種皮 。而當土壤水分含量不足時，會導致棉花種子無法順利發芽 。
2、棉花種子在發芽過程中需要從土壤中吸收種子本身重量60-80%左右的水分，最低臨界吸水量為種子重量52%左右 。
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三、氧氣含量不足
1、土壤透氣性良好，氧氣充足時，棉花種子生理活動旺盛 ， 呼吸作用逐漸增強 ， 細胞內各種酶的活動急劇增強，而當氧氣不足時，棉花種子進行無氧呼吸，產生有毒物質，導致棉花種子不出苗、爛種 。
2、土壤中的氧氣含量保持在10-21%左右為宜 。
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四、種子質量問題
1、棉花種子在長期貯存過程中，活力逐漸下降，導致種子發芽出苗率不理想 。
2、種子在入庫貯存之前，需要進行烘干處理 ， 烘干溫度不宜超過60℃ ， 否則會導致種子發芽出苗率下降 。
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五、覆土厚度問題
棉花種子子葉大 ， 頂土力量較弱，出土難度較大 ， 一旦覆土過厚就會導致棉花種子無法出苗 。一般覆土厚度以1cm左右為宜 。
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