自近年以來，陸續出現了養殖扇貝的大量死亡，并有越來越嚴重的趨勢 。有的海區雖然尚未發生大量死亡，但卻出現了扇貝生長緩慢，出柱率降低的現象 。養殖扇貝大量死亡，一般發生在以下海區：
【扇貝養成中怎樣防止大量死亡】一是海水流速小，交換差的淺海和封閉性較強的內灣 。
二是受陸源有機污染（城鎮污水、養蝦池廢水）影響較大，水體出現富營養化的海區 。
三是扇貝及其他濾食性貝類養殖規模大，密度高，養殖開發的時間較長的海區 。
養殖扇貝大量死亡的原因比較復雜，但從根本上說還是由于養殖密度過大，超過了環境容納量所造成 。從壘局來看 ， 淺海養殖開發不是過度而是不足 。但從某些局部來看，則可能出現開發過度，即養殖數量超過了環境容納量 。這主要表現在兩個方面：
一是餌料不能滿足養殖扇貝的需要，
二是扇貝的糞便在海底沉積加重了底質的負荷 。
另外 ， 死亡還主要發生在高水溫期 。不僅櫛孔扇貝往往發生大量死亡，海灣扇貝死亡更為嚴重 。這是因為，8月份海灣扇貝陸續發育成熟，產卵之后體質衰弱，生理活性顯著下降 。這一時期常常出現大的降雨過程，而降雨往往伴隨著大風發海，結果一方面促進了底質中的有害物質往海水中轉移、擴散，另一方面造成海水渾濁 ， 懸浮物質增多 。再加上高水溫細菌活躍，原生動物大量繁殖，因而造成扇貝大量死亡 。
大量死亡一旦發生，往往引起連鎖反應 。可以說 ， 海灣扇貝產卵后體質衰弱是大量死亡的 內在因素，底質老化則是外部條件，發海誘發了底質對扇貝的不良作用 ， 高水溫則加重了這種作用 。
防止海灣扇貝大量死亡，可采取晚育苗，或者早育苗晚分苗的措施，盡量使其在高水溫期之后產卵、排精 。但是最根本的辦法是合理規劃養殖海區，適當控制養殖密度 。
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