根據《刑事訴訟法》規定 ， 公訴案件和自訴案件的區別主要有：
【公訴自訴案件的區別】(一)案件來源不同 。公訴案件是由國家公訴機關即人民檢察院提起的；而自訴案件是由被犯罪行為侵害的公民、個人或者他的法定代理人、監護人、近親屬直接向人民法院提起的 。
(二)犯罪性質和危害程度不同 。公訴案件中犯罪行為對社會的危害性也比較大，案件一經起訴人民法院必須依法進行審判；而自訴案件犯罪行為對社會的危害性也比較小 ， 因而，在自訴案件中，可以適用和解、調解、撤回自訴等制度 。
(三)舉證責任不同 。自訴案件的舉證責任規定為完全由自訴人承擔；而公訴案件，收集和核對案件事實和證據以及查獲犯罪嫌疑人是司法機關應盡的職責 。
