起始密碼子可以編碼氨基酸，真核生物中多為AUG，對應(yīng)甲硫氨酸；終止密碼子不編碼氨基酸 。通常為UAA、UAG、UGA三個中的一個 。
信使RNA（mRNA）的開放閱讀框架區(qū)中，每3個相鄰的核苷酸為一組 ， 代表一種氨基酸，這種存在于mRNA開放閱讀框架區(qū)的三聯(lián)體形式的核苷酸序列稱為密碼子（codon） 。由A、U、C、G四種核苷酸可組成64個密碼子，其中有61個密碼子可編碼氨基酸 。AUG既編碼甲硫氨酸，又作為多肽鏈合成的起始信號，作為起始信號的密碼子稱為起始密碼子 。
【起始密碼子編碼氨基酸嗎】絕大多數(shù)生物的起始密碼子（initiationcodon）都是AUG，作為多肽鏈合成的起始信號 ， 同時編碼一種氨基酸，原核生物的起始密碼子AUG翻譯對應(yīng)的是甲酰甲硫氨酸（fMet），真核生物的起始密碼子AUG翻譯對應(yīng)的是甲硫氨酸（Met） 。某些原核生物也以GUG和UUG為起始密碼子 。
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