生命的本質：無標度網(wǎng)絡
生命是典型的復雜系統(tǒng)，那么其復雜性必然來自于兩個方面：
- 生物元件的數(shù)量和類型
- 生物元件之間的互作
整體大于部分之和 ?！獊喞锸慷嗟?br />比如，在基因層級，人們現(xiàn)存知道，基因并不是“單干”的，它們之間通常有著密切的關系和互作，各基因共同形成一個復雜的基因調控網(wǎng)絡——
酵母分離體群體的基因調控網(wǎng)絡
生物分子網(wǎng)絡普遍屬于一類特殊的網(wǎng)絡結構——無標度網(wǎng)絡（Scale-free network），特點是“少數(shù)節(jié)點的連接數(shù)遠高于平均值”，可以姑且想象成社會中少數(shù)權貴連接的資源遠遠高于平均水平 。事實上，無標度網(wǎng)絡模型在自然和社會中具有極其普遍的適用性 。
無標度網(wǎng)絡（Scale-free network）的可視化
無標度網(wǎng)絡的結構決定了它能以分形的方式自然地擴張，與生命的演化過程高度一致 。另外，這種網(wǎng)絡具有很強的魯棒性，一是因為非核心節(jié)點的破壞對于網(wǎng)絡的影響較小，二是因為網(wǎng)絡具有冗余性，一條通路破壞后，另一條通路啟用 。
這樣的網(wǎng)絡也可以表征生物體內的環(huán)境調控，即所謂“內穩(wěn)態(tài)”（1929） 。內穩(wěn)態(tài)的概念是對還原論指導下生命“碎片化”研究的矯正，也引發(fā)了一門新的學科——系統(tǒng)生物學，開始關注生物元件構成的網(wǎng)絡及其狀態(tài) 。
網(wǎng)絡的連線——化學修飾
生物大分子作為網(wǎng)絡中的節(jié)點，是生命世界最基本、最主要的元件，那么網(wǎng)絡的連接線就是“化學修飾” 。
化學修飾主要涉及三類蛋白質：“書寫器”、“擦除器”、“閱讀器”，我們一看名字就知道它們的作用了 。這些化學修飾提供了“連接信息”，引導生物大分子之間的互作 。
經(jīng)典生物學通常使用“通路”（Pathway）一詞來描述細胞信號的轉導，不過這其實反映的是一種“線性思維” 。“網(wǎng)絡”（Network）概念則更能體現(xiàn)復雜性思維，表示各通路之間相互耦聯(lián)、相互影響，信息流也不是單向的，而是通過反饋形成雙向流 。
“通路”（Pathway）與“網(wǎng)絡”（Network）
講到這，我們可以順理成章地理解到，生命活動的調控的兩種模式：
- 元件調控：生物大分子的數(shù)量和種類
- 互作調控：生物大分子的化學修飾
生命的不確定性
生命是高度動態(tài)的開放系統(tǒng)，具有很大的不確定性，這種不確定性源自——
- 生物大分子與細胞的高度不均一；
- 各元件間非線性的互作；
- 生物大分子數(shù)量和豐度的隨機擾動（生物學噪音）；
- 生物體各層次涌現(xiàn)出的新性質或功能 。
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