【如何評價這幾個面試MIT生物工程系教職的研究】
講的主要是怎么樣通過高通量設計設計最小的蛋白質(zhì)單元~50aa），來優(yōu)化已有的模型（Baker實驗室的Rosseta），最后提高蛋白質(zhì)最小單元的設計成功率，在Science文章中，設計了ααα，βαββ，αββα，ββαββ四種基本結構單元（自然界存在），用通用模型開始設計的時候，只有ααα有23%成功率，其它設計基本失敗 。在觀察已有成功樣例基礎上，發(fā)現(xiàn)在通用模型里，蛋白質(zhì)疏水性的重要性沒有體現(xiàn)（參數(shù)修正），在4次迭代后，ααα成功率達到了87%，βαββ，ββαββ成功率都在50%左右，只有αββα依然困難，據(jù)此，繼續(xù)用βαββ作為模板，設計了一系列流感病毒HA的結合蛋白，有超過20%成功率 。有些人吹毛求疵，說對于小結構單元的蛋白質(zhì)模型不能應用于大蛋白質(zhì)，覺得這種問題非常無聊，對于任何工作，這是一個萬能句式，蛋白變大了，用同樣方法繼續(xù)學習優(yōu)化模型唄 。對于一個從設計到應用都完整的工作，覺得這已經(jīng)非常成功了 。
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