微生物按其結構、化學組成、生活習性等差異可分成三大類 。
1、真核細胞型微生物，細胞核的分化程度較高，有核膜、核仁和染色體 。胞質內有完整的細胞器，如內質網、核糖體及線粒體等 。真菌屬于此類型微生物；
2、原核細胞型微生物，細胞核分化程度低，僅有原始核質，沒有核膜與核仁，細胞器不很完善 。這類微生物種類眾多，有細菌、螺旋體、支原體、立克次體、衣原體和放線菌等；
【微生物的分類】3、非細胞型微生物，沒有典型的細胞結構，亦無產生能量的酶系統，只能在活細胞內生長繁殖 。病毒屬于此類型微生物 。
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