常見的水生微生物：真菌、細菌、原生動物、噬菌體 。水生微生物在生態系統中的地位非常重要，它們主要起到分解的作用 。若沒有水生微生物，那么動植物殘體、排泄物等無法循環，物質將被鎖在有機質中不能被生產者利用，會導致整個生態系統崩潰 。
【水中常見的微生物有哪些 水中常見的微生物有哪些以及他們的特征是什么】細菌是重要的分解者，他們分布很廣而且可以分解有機物，一公克的土壤通常包含4千萬個細菌細胞，而且地球上的細菌形成一種生物量，這種生物量是超過全部現存的植物和動物，細菌在滋養物的循環是重要的，而許多滋養物的循環是依靠生物 。
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不同于細菌，真菌是單細胞生物，大多腐生營養真菌會增加分歧網狀系統的菌絲 。細菌的增生是被限制而且吃暴露在表面的有機物，真菌可以使用他們的菌絲去穿透較大的有機物質 。
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