補發工資計算個人所得稅的話，目前的普遍做法是允許還原至所屬月份計算繳納個人所得稅，計算公式為：所屬月份補發工資應納稅額={[（所屬月份補發工資 原所屬月份的工資薪金所得）—費用減除額]×適用稅率-速算扣除數}—原所屬月份已繳納的個人所得稅 。
【法律依據】
【補發工資應怎樣計算個稅】《個人所得稅法》第九條規定，個人所得稅以所得人為納稅人 ， 以支付所得的單位或者個人為扣繳義務人 。納稅人有中國公民身份號碼的，以中國公民身份號碼為納稅人識別號；納稅人沒有中國公民身份號碼的，由稅務機關賦予其納稅人識別號 。扣繳義務人扣繳稅款時 ， 納稅人應當向扣繳義務人提供納稅人識別號 。
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