1、培養方向不同:根據我國的有關規定，普通碩士教育以培養教學和科研人才為主，授予學位的類型主要是學術型學位；而專業碩士是具有職業背景的碩士學位，為培養特定職業高層次專門人才而設置；
2、招生條件不同:專業碩士要求報考者有一定年限的工作經歷，而普通碩士則不需要 。絕大多數專業碩士還要求在職人員報考需要經所在單位或相應管理部門的同意，有的甚至要求所在單位推薦等；
【學術碩士與專業碩士有什么區別】3、招生考試不同:對學生來說，普通碩士的招生考試只有年初的統考，而統考以外的專業考試則由各招生單位自行命題閱卷 。專業碩士的招生考試有十月份的聯考和年初的統考兩次機會，考生可以自行選擇 ， 而這兩大國家級別的考試的專業考試 ， 也由各招生單位自行命題閱卷 。
