診斷魚病最好是先作現場調查，了解病魚在池中的各種表現，了解飼養狀況，凋查發病情況和發病史及環境條件，然后再針對每個個體進行肉眼檢查、鏡檢以至水質化驗 。
(1)肉眼檢查：肉眼檢查是最常用的簡便方法，但必須掌握好各種病癥的特征癥狀 。材料必須是沒死或剛死的魚，檢查部位由表及體 。
①看體表：體表有白色叢生毛狀物，在水中呈灰白棉花狀多為水霉病，少數可能是纖毛蟲類的鐘蟲、聚縮蟲等（多為甲殼動物） 。魚尾柄發白病變部位向腹、胸部蔓延多為自皮病，魚眼混濁、白內障 ， 嚴重時晶體膜脫落可能為復口吸蟲?。焊孛藕熘? ，輕壓腹部有黃色粘液從腸道流出則可能為細菌性腸炎 。夏花魚種頭部和嘴周圍色素消失，呈白頭白嘴（在水中更明顯），多為白頭白嘴病 ， 在尾柄及腹部兩側形成近圓形紅色病灶多為打印病 ， 對一些肉眼可見的病原生物，如錨頭蚤 ， 在魚體表、鰓、口腔等處可見針狀蟲體：紅線蟲，在鰭的間膜中可見紅色蟲體 ， 螞蟥寄生則可見螞蟥 。魚鲺等肉眼可見魚體表有魚鲺附著 。
②看鰓：首先看鰓蓋內表皮有沒有腐爛或變成透明現象，如有，并且打開鰓蓋發現鰓絲末端有腐爛現象多為細菌性爛鰓；如果沒有，則看上面有無寄生蟲 ， 如無寄生蟲，而鰓比正常魚的鰓片顏色較白，略帶小紅點則可疑為鰓霉病 。鰓上有寄生蟲寄生，則鰓蓋張開，鰓絲腫大 。寄生蟲為白色胞囊者可疑為粘孢子蟲病，白色蛆狀物多為中華鳋，如鰓上粘液較多則寄生蟲有車輪蟲、隱鞭蟲、斜管蟲、魚波豆蟲、指環蟲等 。
⑧看內臟：剖開腹部看內臟有無腹水 ， 有腹水，而體表伴有出血癥狀，多為細菌感染：無腹水，觀察肝臟有無病變，如脂肪肝等 。然后看胚內是否有寄生蟲，如魚怪、線蟲、絳蟲等 。再觀察腸壁充血發炎現象，腸彈性差又充血發炎 ， 肛門紅腫，多為細菌性腸炎；剪開腸，腸壁內有成片或稀散小白點為球蟲、粘孢子蟲、對線蟲、棘頭蟲等 ， 芝麻狀的小蟲可疑為側殖吸蟲 。
【如何診斷魚病 如何判斷魚病】(2)用顯微鏡檢查和水質化驗：對于一些肉眼難以分辨的癥狀，病原則需作進一步分析，在顯微鏡下觀察是否有可見病原生物，或進行病理切片觀察，必要時作一些水質化驗，檢查水體有無重金屬污染、農藥污染等 。
